1. Является постоянно действующим исполнительным и распорядительным органом Учреждения, осуществляет руководство Учреждением на принципах единоначалия, организует всю работу и несет ответственность за деятельность .
2. Назначается на должность и освобождается от должности руководителем ФАНО России в установленном порядке.
3. Представляет интересы Учреждения в органах государственной власти, органах местного самоуправления и во взаимоотношениях с юридическими и физическими лицами по вопросам, отнесенным к его компетенции, без доверенности действует от имени Учреждения, совершает сделки и иные юридические действия, выступает в судах.
4. Осуществляет кадровое, материально-техническое, финансово-экономическое, психолого-педагогическое обеспечение для реализации основной общеобразовательной программы Учреждения.
5. Несет полную персональную ответственность за деятельность Учреждения, в том числе за невыполнение задач и функций Учреждения, а также за несвоевременное представление отчетности и результатов деятельности Учреждения, за нецелевое использование средств федерального бюджета, принятие обязательств сверх бюджетных средств и средств, полученных в установленном порядке от приносящей доход деятельности, получение кредитов (займов), приобретение акций, облигаций и иных ценных бумаг и получение доходов (дивидендов, процентов по ним), а также за другие нарушения бюджетного законодательства Российской Федерации.